• Paleoecología y Palinología del Neógeno del centro de México.
• Cambio climático global con énfasis en variaciones en la vegetación y en el clima durante el Cuaternario tardío
• Historia de los ecosistemas ante perturbaciones tales como fuegos, actividad volcánica, cambio climático y actividad antrópica.
• Cambios ambientales durante el Antropoceno.
• Reconstrucción de los regímenes de incendios pasados por medio del análisis cualitativo y cuantitativo de series de tiempo de carbón vegetal de secuencias sedimentarias lacustres durante el Cuaternario.
• El impacto del fuego en la estructuración y configuración de las asociaciones de plantas por medio del análisis palinológico.
• Identificación y análisis de morfotipos de carbón vegetal moderno y fósil para identificar los tipos de combustibles asociados a la actividad de fuego pasada, antes y después del impacto humano.
• Impacto del fuego en los cambios químicos y biogeoquímicos de los ecosistemas lacustres a largo plazo.
• Paleoceanografía del Cuaternario tardío en el Golfo de México y el Pacífico mexicano mediante análisis micropaleontológicos y geoquímicos.
• Reconstrucción de procesos oceánicos y su papel en la modulación de la variabilidad climática natural a escalas glacial-interglacial y milenaria.

En nuestro laboratorio se estudian un conjunto de indicadores biológicos y no biológicos preservados en secuencias sedimentarias lacustres, marinas y fluviales. También se lleva a cabo el estudio del polen, esporas y otros palinomorfos modernos. Las secuencias son descritas y muestreadas para análisis, posteriormente las secuencias son almacenadas en cámaras frías, así como las muestras que han sido procesadas. El laboratorio cuenta con dos secciones, un área donde se lleva a cabo todo el proceso de extracción de los microfósiles a través de procedimientos químicos.

Otra área es la denominada zona limpia donde se realizan los análisis geoquímicos de los sedimentos como es el contenido de carbono y nitrógeno de las muestras con el analizador Thermo Scientific FLASH 2000, el análisis elemental de los sedimentos con analizadores de florescencia de rayos X Niton y la documentación a través de la fotografía de microfósiles con un microscopio de barrido de escritorio.

En el laboratorio se cuenta con las bases de datos de varios de los sitios estudiados, también se están desarrollando las bases de datos de los granos de polen modernos (Tekia) y fósiles documentados en los diversos estudios realizados por el personal del laboratorio.